住房公积金作为一项强制社会福利制度已在我国推广了21年，但它的管理低效也广受诟病，数据更显示公积金制度对大多数低收入者难有实质性帮助。2008年全国住房公积金使用情况显示扣除备付资金后的沉淀资金为3193.02亿元。（之后官方再没公布过最新的公积金使用情况）2011年末证监会主席郭树清透露，全国住房公积金累计已经缴存了3.9万亿元，专家估测沉淀资金已超4000亿元。
2.低效率运营损害多数人利益,升值无路 保值都难,按照《住房公积金管理条例》规定，住房公积金只可以通过发放住房公积金个人住房贷款、国债投资、银行存款三种方式实现增值收益。
以2011年为例

五年期以上公积金贷款利率 4.90%

五年期国债年化收益率 约5%   

五年期定期存款年利率 5%

均跑不过当年CPI 5.4%

监管不力 大案频频

2005年湖南衡阳2.53亿元住房公积金被挪用,2008年广东湛江4.6亿元公积金被挪用炒股。